Os Açores, como todas as ilhas e terras de além-mar, começaram por estar sujeitos à jurisdição da Ordem de Cristo, exercida pelo vigário nullius de Tomar. Ao ser criado o bispado do Funchal (1514), passaram para a jurisdição deste. A pedido de D. João III, Clemente VII criou (1533) o bispado de S. Miguel, mas faleceu antes de expedir a bula de erecção. No ano seguinte, Paulo III erigiu o bispado de S. Salvador, dando-lhe por Catedral a igreja do mesmo nome na cidade de Angra, ficando esta Sé sufragânea do arcebispo do Funchal até 1550, data em que passou para a metrópole de Lisboa. A jurisdição do bispo de Angra abrange todas as ilhas do Arquipélago.